Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MSI1O43347 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MSI1O43347 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSI1O43347 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSI1O43347 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSI1O43347 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSI1O43347 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSI1O43347 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MSI1O43347 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSI1O43347 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MSI1O43347 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 355.7 ms