Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms