Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms