Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms