Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SERINC1Q9NRX5 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms