Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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TMEM27Q9HBJ8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM27Q9HBJ8 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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