Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RSG1Q9BU20 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms