Protein–RNA interactions for Protein: Q99996

AKAP9, A-kinase anchor protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 3,911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9Q99996 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 AC000078.1-201ENST00000420617 682 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 CAP2-207ENST00000493172 861 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 HNRNPA1P59-201ENST00000430583 918 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 AC003688.2-201ENST00000576271 415 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 RN7SL76P-201ENST00000482435 289 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
AKAP9Q99996 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms