Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms