Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCG3Q8WXD2 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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