Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
APOBEC4Q8WW27 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms