Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RUFY3Q7L099 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms