Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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