Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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ATP6V1FQ16864 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ATP6V1FQ16864 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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