Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
APOFQ13790 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
APOFQ13790 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
APOFQ13790 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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