Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMB3Q13751 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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LAMB3Q13751 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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LAMB3Q13751 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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LAMB3Q13751 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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LAMB3Q13751 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMB3Q13751 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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LAMB3Q13751 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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LAMB3Q13751 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMB3Q13751 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMB3Q13751 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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LAMB3Q13751 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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LAMB3Q13751 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMB3Q13751 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMB3Q13751 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMB3Q13751 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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LAMB3Q13751 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMB3Q13751 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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LAMB3Q13751 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMB3Q13751 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMB3Q13751 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LAMB3Q13751 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMB3Q13751 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LAMB3Q13751 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMB3Q13751 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMB3Q13751 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMB3Q13751 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LAMB3Q13751 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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LAMB3Q13751 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMB3Q13751 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMB3Q13751 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMB3Q13751 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LAMB3Q13751 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMB3Q13751 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMB3Q13751 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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