Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 DUSP10-201ENST00000366899 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 DNAJC24-202ENST00000465995 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PMS2P11Q13670 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms