Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTCH1Q13635 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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