Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNH2Q12809 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms