Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD47Q08722 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD47Q08722 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD47Q08722 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CD47Q08722 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD47Q08722 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD47Q08722 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD47Q08722 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD47Q08722 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD47Q08722 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD47Q08722 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD47Q08722 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD47Q08722 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD47Q08722 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD47Q08722 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD47Q08722 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD47Q08722 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD47Q08722 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD47Q08722 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CD47Q08722 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD47Q08722 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CD47Q08722 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms