Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ARCN1P48444 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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