Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TM4SF4P48230 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms