Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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PTPRBP23467 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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PTPRBP23467 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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PTPRBP23467 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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PTPRBP23467 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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PTPRBP23467 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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