Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM21P19474 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms