Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
J3QRK9 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
J3QRK9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
J3QRK9 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
J3QRK9 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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