Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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