Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
SMIM2Q9BVW6 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SMIM2Q9BVW6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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