Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms