Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN18Q96SJ8 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms