Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP13Q92995 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP13Q92995 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms