Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms