Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms