Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC142Q17RM4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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