Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HADHQ16836 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HADHQ16836 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HADHQ16836 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HADHQ16836 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HADHQ16836 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HADHQ16836 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HADHQ16836 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HADHQ16836 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HADHQ16836 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
HADHQ16836 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HADHQ16836 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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