Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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