Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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