Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA3Q08378 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms