Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms