Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC5A3P53794 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms