Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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ARCN1P48444 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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ARCN1P48444 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ARCN1P48444 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARCN1P48444 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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