Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms