Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms