Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRHP20396 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRHP20396 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRHP20396 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRHP20396 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
TRHP20396 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 MIR4435-2HG-201ENST00000308604 552 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 Z84721.1-201ENST00000438841 372 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 ATP5G1P7-201ENST00000444398 400 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 AL669831.3-208ENST00000634337 891 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRHP20396 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 AC022424.2-201ENST00000514848 454 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 AC068134.4-201ENST00000613365 122 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 IGHD-202ENST00000613640 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRHP20396 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRHP20396 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRHP20396 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRHP20396 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRHP20396 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRHP20396 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRHP20396 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRHP20396 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRHP20396 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRHP20396 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRHP20396 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRHP20396 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRHP20396 FAM25E-201ENST00000411791 322 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRHP20396 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRHP20396 PGAP2-219ENST00000479072 894 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRHP20396 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRHP20396 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRHP20396 AC105424.1-201ENST00000514583 209 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRHP20396 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRHP20396 AP001979.1-201ENST00000529222 751 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRHP20396 AC044839.1-201ENST00000532307 541 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRHP20396 SEC11A-203ENST00000558134 971 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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