Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CXCL2P19875 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms