Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RARAP10276 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARAP10276 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARAP10276 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARAP10276 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARAP10276 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARAP10276 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARAP10276 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARAP10276 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARAP10276 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARAP10276 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARAP10276 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARAP10276 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARAP10276 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARAP10276 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARAP10276 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARAP10276 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARAP10276 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARAP10276 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARAP10276 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARAP10276 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARAP10276 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARAP10276 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARAP10276 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARAP10276 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARAP10276 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARAP10276 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RARAP10276 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms