Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOEP02649 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOEP02649 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOEP02649 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOEP02649 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOEP02649 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOEP02649 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOEP02649 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOEP02649 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOEP02649 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOEP02649 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOEP02649 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOEP02649 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOEP02649 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOEP02649 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOEP02649 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOEP02649 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOEP02649 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOEP02649 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOEP02649 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOEP02649 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOEP02649 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOEP02649 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOEP02649 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOEP02649 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOEP02649 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOEP02649 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOEP02649 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOEP02649 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOEP02649 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms