Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUX2O14529 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUX2O14529 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUX2O14529 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUX2O14529 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUX2O14529 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUX2O14529 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUX2O14529 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUX2O14529 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUX2O14529 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUX2O14529 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUX2O14529 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUX2O14529 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUX2O14529 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUX2O14529 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CUX2O14529 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUX2O14529 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUX2O14529 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUX2O14529 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUX2O14529 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CUX2O14529 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUX2O14529 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUX2O14529 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUX2O14529 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUX2O14529 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUX2O14529 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUX2O14529 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUX2O14529 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUX2O14529 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUX2O14529 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUX2O14529 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUX2O14529 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUX2O14529 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUX2O14529 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUX2O14529 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUX2O14529 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUX2O14529 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUX2O14529 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUX2O14529 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CUX2O14529 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUX2O14529 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUX2O14529 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUX2O14529 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUX2O14529 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUX2O14529 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUX2O14529 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUX2O14529 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUX2O14529 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUX2O14529 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUX2O14529 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUX2O14529 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUX2O14529 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUX2O14529 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUX2O14529 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUX2O14529 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUX2O14529 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUX2O14529 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUX2O14529 S100A7A-202ENST00000368728 440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUX2O14529 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUX2O14529 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CUX2O14529 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUX2O14529 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUX2O14529 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUX2O14529 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CUX2O14529 AC002511.3-201ENST00000638098 420 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CUX2O14529 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUX2O14529 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUX2O14529 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUX2O14529 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUX2O14529 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUX2O14529 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUX2O14529 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUX2O14529 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUX2O14529 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUX2O14529 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUX2O14529 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUX2O14529 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUX2O14529 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUX2O14529 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUX2O14529 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUX2O14529 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CUX2O14529 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUX2O14529 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUX2O14529 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUX2O14529 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUX2O14529 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUX2O14529 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUX2O14529 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUX2O14529 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUX2O14529 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUX2O14529 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUX2O14529 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUX2O14529 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUX2O14529 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUX2O14529 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUX2O14529 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUX2O14529 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUX2O14529 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUX2O14529 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUX2O14529 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms