Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ZNF839A8K0R7 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ZNF839A8K0R7 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ZNF839A8K0R7 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ZNF839A8K0R7 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ZNF839A8K0R7 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ZNF839A8K0R7 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF839A8K0R7 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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