Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC8Q9Y2L5 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms