Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH22Q9UJ99 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms